Mục tiêu: Xây dựng quy trình phân tích kiểu gen của đa hình đơn nucleotide rs7498665 trên gen SH2B1 bằng phương pháp cặp mồi đặc hiệu alen (AS-PCR) trên các mẫu ADN tổng số của người trưởng thành.

Phương pháp: Các cặp mồi đặc hiệu dùng cho phương pháp AS-PCR được thiết kế trên phần mềm tin sinh học Primer3 và điều kiện của phản ứng PCR được tối ưu hóa với các dải nhiệt độ bắt cặp khác nhau. Độ tin cậy của phương pháp AS-PCR được khẳng định lại bằng phương pháp giải trình tự Sanger.

Kết quả: Đã xây dựng và tối ưu hóa được quy trình phân tích kiểu gen của rs7498665 trên gen SH2B1 bằng phương pháp AS-PCR với kết quả chính xác.

Kết luận: Quy trình AS-PCR để phân tích kiểu gen của SH2B1 rs7498665 có độ chính xác cao, đưa ra kết quả nhanh và có thể thực hiện với cỡ mẫu lớn hơn cũng như trên các quần thể khác nhau hướng tới nghiên cứu mối liên quan của đa hình này đối với bệnh thừa cân, béo phì ở người Việt Nam.

Aims: To develop a genotyping protocol for single nucleotide polymorphism (SNP) rs7498665 on SH2B1 gene using allele-specific primer method (AS-PCR) on total DNA samples of adult people.

Methods: Specific primers for the AS-PCR method were designed using Primer3 bioinformatics software and PCR reaction conditions were optimized at different annealing temperatures. The reliability of the AS-PCR method was confirmed by Sanger sequencing.

Results: A protocol for geneotyping the rs7498665 has been developed and optimized using the AS-PCR method with accurate results.

Conclusion: The AS-PCR protocol for genotyping SH2B1 rs7498665 is highly accurate, provides rapid results and can be performed with larger sample sizes as well as on different populations to study the association of this polymorphism with overweight and obesity in Vietnamese populations.